兵团四十九团位于新疆图木舒克市。下辖：

659003509400 123 团部

659003509501 220 一连

659003509502 220 二连

659003509503 220 三连

659003509504 220 四连

659003509505 220 六连

659003509506 220 七连

659003509507 220 八连

659003509508 220 九连

659003509509 220 十连

659003509510 220 十一连

659003509511 123 十二连

659003509512 220 十三连

659003509513 220 十四连

659003509514 220 十五连

659003509515 220 十六连

659003509516 220 十八连

659003509517 220 二十连

659003509518 220 二十一连

659003509519 123 园林站生活区

659003509520 122 四十九机务二站生活区

659003509521 220 农一队

659003509522 220 农二队

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